När Fluttershy och hennes bästa kompisar har picknick med sin nya vän Tempest Shadow far de plötsligt ett meddelande fran sjöponnyernas prinsessa Skystar. Hon har utegangsförbud och är jätteuttrakad och undrar om inte vännerna kan komma pa besök. Fluttershy bestämmer sig genast för att aka dit och hälsa pa.Men hon hinner knappt förvandlas till en sjöponny innan hon kastas in i ett nytt äventyr under havets yta. Det är nagot som inte stämmer i Seaquestria och Fluttershy maste hjälpa till - annars kan vad som helst hända! -