La Lila i en Tom, dos bessons molt especials, un dia mengen una herba misteriosa que els fa petits com ratolins. A partir d'aleshores poden parlar amb els animals del bosc i viure aventures increibles.
Aquesta vegada, una forta tempesta fa que el rierol es desbordi i amenaci les llars dels animals del bosc, que demanen ajuda als Minitwins.