I hungerkravallernas Stockholm varen 1917 rör sig en maskerad man som kallar sig herr Agnefit. Ett mord har begatts pa en officer med förbindelser i den svenska makteliten, och herr Agnefit samlar en grupp udda existenser för att lösa mordet. I gruppen ingar en labil före detta tsaragent med en böjelse för sexualvald, en svärmisk studentska med stora talanger för jiu jitsu, en alkoholiserad medelalders kvinna som tal hur mycket stryk som helst, en före detta uppvisningsbrottare, en lettisk bankranare och en dansk kälkborgare med en unik begavning för att orsaka förödelse. Herr Agnefit är dock mycket förtegen om varför han vill att mordet ska lösas, och snart börjar gruppens medlemmar ana orad.
Järnskallen är en brett upplagd äventyrsroman vars förvecklingar spänner fran samhällets högsta toppar till ett svunnet Stockholms undre värld, där tva rivaliserande gäng är inbegripna i ett blodigt krig.
Järnskallen ingar i Vanadisserien som fortsätter med Den blinde konunens spira.