Ved Retten I Lyngbys dom af 12. juni 2009 blev Stein Bagger efter en hurtigt afviklet tilstaelsessag straffet med fængsel i syv ar for særdeles omfattende dokumentfalsk og bedrageri. At straffen, som udmalingsmæssigt er blandt de længste i Danmark for økonomisk kriminalitet, alligevel ikke blev strengere skyldtes ifølge dommens konklusion, at: "Stein Bagger o et ekstraordinært omfang har medvirket til sagens opklaring, saledes at sagen uanset sit betydelige omfang har kunnet fremmes til dom inden for syv maneder efter anmeldelsen til politiet. Det er videre tillagt betydning, at Stein Bagger er fremkommet med oplysninger, der er afgørende for opklaringen af strafbare handlinger begaet af andre."